Хмельницкий встретил это известие «как сумасшедший, который ума лишился, закричал и заявил: уж, дети, о том не печальтесь! Я знаю, что с этим делать: нужно отступить от руки царского величества, а пойдем туда, куда вышний Владыко повелит — не только под христианином государем, но и под бусурманином».
Начало расхождения с Москвой, шведские военные неудачи — толкнули гетмана в сторону его бывшего врага — трансильванского князя Георгия Ракоци и в сентябре он подписал с ним союзный договор. В январе 1657 года казацкие полки под командование А. Ждановича и И. Богуна (до 20 тысяч человек) отправились на помощь Ракоци, который выступал в союзе со шведами против Польши. Вместе с войском Ракоци казаки дошли вплоть до Варшавы, мстя за недавнее разорение Брацлавщпны. Как писал украинский летописец: «Антон, судья генеральный казачий, ходил в зиме на венгров… Варшаву, Краков и иншие города над-за Вислой воевал».
Этот поход в условиях русско-шведской войны и Виленского перемирия с Речью Посполитой было практически разрывом Переяславских соглашений гетманства с Московским государством. Как пишет Б. Н. Флоря, объясняя причину напряженности в русско-украинских отношениях, «гетман продолжал расценивать положение, сложившееся на международной арене, совсем не так, как царь и его советники».
В апреле 1657 г. в Чигирин прибыл посол польского короля С. К. Веневский. Хотя никаких конкретных договоренностей с Б. Хмельницким достигнуто не было, но по условиям Переяславских соглашений гетман вообще не мог иметь сношений с поляками, и должен был задерживать их посланников. Разумеется, Веневского в Чигирине никто не задержал.
Вторым очагом конфликта оставалась Белоруссия. Уже в январе 1656 года Б. Хмельницкий издал указ, назначив своего зятя, И. Нечая, полковником Белорусским, отдав под его управление территории до Могилева. Чаусов, Нового Быхова и Гомеля.
Наконец, в апреле 1657 года умер киевский митрополит С. Коссов. Хмельницкий не только не проинформировал об этом царя, но и самовольно подписал универсалы о проведении церковного собора. Между тем Алексей Михайлович рассматривал смерть митрополита как удобный предлог для переподчинения Киевской митрополии московскому патриарху. На этом фоне у царя возникли разногласия с Никоном, который не хотел ссориться с Константинопольским патриархом и косвенно поддерживал позицию Б. Хмельницкого.
К сложной внешнеполитической обстановке добавились внутренние проблемы. Отсутствие реестра и образование огромного числа «показаченных», не имевших в мирное время средств к существованию, создавали социальную базу для взрывов недовольства. Опасность бунтов стала проявляться уже в последние годы гетманства Хмельницкого. Очагом напряженности и центром недовольства стало Запорожье. Тут сказывалась вражда, существовавшая между запорожцами и реестровыми казаками — как между рядовыми, так и среди старшины. Лидеры Запорожской Сечи не допускалась до управления гетманством, а тем более — до его внешней политики.
Летом 1657 г., когда Хмельницкий отправил против татар войско во главе со своим юным сыном Юрием, произошел первый открытый бунт. Присутствие в войске русского воеводы И. Желябужского придало ему особый характер. Старшин обвинили в попытке «воевать Польшу» без «государева указу». Такое развитие событий было на руку царскому правительству, которое серьезно опасалось независимой внешней политики гетмана.
В июне в Чигирин прибыл Ф. Бутурлин. Главной причиной посольства было недовольство Москвы внешними сношениями гетмана. Хмельницкого упрекали, что он забыл «присягу свою перед святым евангилием и верное подданство». Стремясь усилить контроль за гетманом, русские выдвинули требование, чтобы воеводы находились в Чернигове, Переяславле и Нежине. Недовольство вызывал и тот факт, что из Гетманства ни разу не поступало в московскую казну собранных налогов. Переговоры проходили на повышенных тонах, стороны обменивались резкими заявлениями.
Смерть Богдана, умершего от инсульта 6 августа 1657 г., предотвратила назревавший конфликт. Официального разрыва не произошло. Похоронили Богдана в Ильинской церкви в любимом Субботове, рядом с могилой Тимоша. Однако уже в 1664 г. польский полководец С. Чар-нецкий захватил Субботов и велел выбросить прах великого человека. Правда, местные краеведы уверены, что казакам удалось спрятать от поляков прах Богдана.
Руина
Умирая, Б. Хмельницкий завещал избрать гетманом своего 16-летнего сына Юрия, который к тому же обладал слабым здоровьем. На Субботовской раде старшина, нарушая завещание гетмана, решила отправить Юрия учиться в Киев. В качестве регента был назначен генеральный писарь Иван Выговский, умный, образованный православный шляхтич, практически руководивший при Б. Хмельницком всей внешней политикой. Правда он не был из казаков и был женат на польке сенаторского рода. В сентябре Чигиринская рада утвердила Выговского единоличным гетманом, но власть его была слабой. К тому же, ему пришлось столкнуться с огромным количеством накопившихся еще при Б. Хмельницком проблем — внутренних и внешних.
Первая в истории Украины легитимная смена власти проходила очень непросто. Никогда прежде украинские гетманы не обладали государственной властью, поэтому теперь все было иначе. Выговский, нарушив завещание Б. Хмельницкого, сам создал прецедент, получив власть не вполне легитимным образом. Началась ожесточенная борьба старшинских группировок. Многие заслуженные полковники считали себя вправе претендовать на место гетмана. Старшинские группировки начали использовать порожденный восстанием Хмельницкого анархо-разрушительный элемент, в лице масс показаченных и Запорожья.
С этого момента в Украинском гетманстве складывается несколько традиционных партий: крымская, шведская, русская и польская. Большинство их лидеров преследовали только одну цель — добиться собственной власти путем внешней поддержки. А Запорожье было против всякой твердой власти вообще. Им противостояла государственная группировка старшины, выступавшая за сохранение и преумножение автономии гетманства, за продолжение независимой внешней политики Хмельницкого и укрепление власти казацкой администрации во внутренней жизни Украины.
В октябре 1657 г. Корсунская рада еще раз утвердила Выговского в качестве гетмана, и сразу же был заключен договор со Швецией. Это была попытка в условиях внутренних смут укрепить внешнее положение Украины. Хотя в договоре подчеркивалось, что с московским царем «Войско Запорожское связано тесным союзом и будет сохранять ему верность нерушимо», однако самого факта таких переговоров было достаточно для Москвы, чтобы убедиться в своеволии нового гетмана.
Выговский занимал непреклонную позицию и по двум другим острым вопросам: относительно Белоруссии и подчиненности Киевского митрополита. Не соглашался он и на расширение власти русских воевод. Поэтому когда против гетмана в ноябре началось восстание запорожцев, а затем и восстание Полтавского полка во главе с М. Пушкарем, царское правительство заняло благодушно-выжидательную позицию. В Москве принимали посольства восставших, отправляли увещевательные письма обеим враждующим сторонам, этим самым только еще больше провоцируя расширение бунта, придавая уверенность восставшим (убежденным в поддержке царя) и донельзя ослабляя позицию гетмана.
Ситуация вышла из-под контроля и в феврале 1658 г. произошло первое открытое столкновение восставших с войсками Выговского. Гетманская власть держалась на волоске. В этих условиях И. Выговский заключил тайное соглашение с воеводой Б. М. Хитрово, практически согласившись на сильное ограничение автономии Украинского гетманства и переподчинение киевского митрополита Московскому патриарху. Но неожиданная опала патриарха Никона, пользовавшегося большим авторитетом и влиянием среди старшины и духовенства Украины и озабоченность Москвы внутренними проблемами, сорвали исполнение этого соглашения. Выговский был напуган, а русские власти не реагировали оперативно на события в гетманстве.
Только в июне 1658 г. Г. Г. Ромодановский получил, наконец, приказ оказать поддержку Выговскому. Но было поздно — гетман уже призвал на помощь орду и в битве под Полтавой разбил войска восставших. М. Пушкарь был казнен.