Храм освещался через большое окно на потолке, а по бокам был окружен коридорами. Представление о его внутреннем убранстве можно составить по описанию 1896 г. Одноярусный, белый, украшенный местами позолотой иконостас имел резные вызолоченные Царские врата. Все три местные иконы прекрасной итальянской живописи были без риз. За правым клиросом в особом киоте помещалась небольшая икона с изображением апостола Павла, мученицы царицы Александры и святителя Димитрия Ростовского с надписью под ней, сообщавшей, что образ поставлен «усердием благоверного государя великого князя Павла Александровича в память совершившегося здесь миропомазания благоверного великого князя Димитрия Павловича». За левым клиросом находилась в киоте и в серебряном окладе другая памятная икона – благоверного князя Александра Невского, преподобного Иосифа песнописца и великомученика Георгия Победоносца, сооруженная служащими при Александрийском дворце в память о чудесном спасении императора Александра II в 1879 г. В церкви на богослужениях часто присутствовали владельцы дворца – великий князь Сергей Александрович и его супруга великая княгиня Елизавета Федоровна. Здесь в начале XX века впервые в Москве стали проводить богослужения в новогоднюю ночь, получившие позже широкое распространение.
Группа специалистов, осмотревшая церковь в 1921 г., постановила: «Храм подлежит учету и охране Комиссией по охране памятников искусства и старины в его целом, как памятник быта». Особо были отмечены находившиеся в алтаре иконы Господь Саваоф и Спас Нерукотворный академической работы. В октябре 1921 г. службы Моссовета выписали мандат на проверку церковного имущества и опечатали храм. Александрийский дворец приспособили под Музей мебели, затем хранилище Музея народоведения, а с 1935 г. в нем расположился президиум Академии наук СССР.
Александры царицы, мученицы, в Александровском военном училище церковь (уничтожена).
Храм находился во дворце, выстроенном в 1792 г. архитектором Ф.И. Кампорези для генерал-майора С.С. Апраксина (улица Знаменка, дом № 19). В 1835 г. в этот дворец из дома Разумовского на Гороховом поле был переведен Александровский сиротский институт, где жили и учились дети военных, умерших от эпидемии холеры. В 1850 г. его преобразовали в кадетский корпус, а в 1863 г. – Александровское военное училище, готовившее пехотных офицеров.
Церковное имущество бывшей в доме графа Разумовского церкви иконы Божией Матери «Взыскание погибших» (основана в 1831 г.), кроме престола и иконостаса, было перенесено в новое помещение сиротского института. Здесь в 1851 г. освятили церковь во имя мученицы царицы Александры, содержавшуюся на деньги Московского опекунского совета. В ней находились памятные доски, серебряные венки и другие мемориальные предметы, связанные с историей училища и его выпускниками. В апреле 1900 г. училище и его храм посетил император Николай II, и ему показали достопамятные святыни: складень из образов великомученика Георгия, святителя Николая и мученицы царицы Александры, присланных в дар выпускниками училища – офицерами Варшавского военного округа; икону благоверного князя Александра Невского, пожалованную императором Александром II и написанную по указанию императора Николая I в память рождения наследника престола.
В начале 1919 г. представители Музейного отдела Наркомпроса изъяли из храма часть икон и мемориальных предметов для размещения их в Военно-историческом музее. В мае 1919 г. помещение училища было передано Реввоенсовету, и домовую церковь окончательно упразднили. В 1944–1946 гг. по проекту видных советских архитекторов А.А. Мндоянца и М.В. Посохина двухэтажное здание бывшего училища надстроили до пяти этажей. Ныне в нем располагаются подразделения Министерства обороны РФ.
Алексия, митрополита Московского, святителя на Глинищах церковь (уничтожена).
Храм находился между улицами Тверская и Большая Дмитровка, в Глинищевском переулке. Впервые он упоминается в документах в 1620-е гг. К 1690 г. на старом месте возводится новая Алексиевская церковь с приделом святителя Николая. В середине XVIII века был устроен второй придел – в честь иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость». Новую колокольню выстроили в 1780-е гг. Несмотря на переделки, к началу XX века пятиглавый храм, в основном, сохранил свой первоначальный облик. Он был украшен многими старинными иконами и художественной утварью. В пятиярусном главном иконостасе выделялись несколько икон, написанные в 1689–1690 гг. известным иконописцем Тихоном Филатьевым: храмовый образ святителя Алексия, Иоанн Предтеча и другие. В Николаевском приделе находился замечательный резной образ святителя Николая конца XVII века, украшенный вызолоченной ризой и митрой. К особо почитаемым святыням относился большой, старинный, унизанный жемчугом серебряный крест с частицами святых мощей, в том числе московских святителей Алексия и Филиппа.
В ноябре 1929 г. памятник XVII века с замечательным внутренним убранством – церковь святителя Алексия на Глинищах – передали под зернохранилище. А спустя пять лет снесли, выстроив на его месте жилой дом.
Алексия, митрополита Московского, святителя в Зачатьевском монастыре часовня (2-й Зачатьевский переулок, дом № 2).
Находится при входе в монастырь, под надвратным храмом Спаса Нерукотворного Образа, справа от ворот. Место ее на фасаде храма отмечено иконой святителя Алексия, митрополита Московского. Зачатьевский монастырь был основан святителем Алексием, митрополитом Московским в 1360 г. Его первыми насельницами были родные сестры святителя игуменья Иулиания и монахиня Евпраксия. До закрытия монастыря в 1927 г. и разрушения монастырского собора Рождества Пресвятой Богородицы в нем существовал придел во имя святителя Алексия. Богослужения в монастыре были возобновлены в 1993 г. Часовня во имя святителя Алексия была устроена в 1999 г. Святые врата и своды часовни расписаны художником Александром Царенковым.
Алексия, митрополита Московского, святителя, в Ольгинском приюте церковь (уничтожена).
Детский приют был основан в 1844 г. и с согласия великой княжны Ольги Николаевны, дочери Николая I (впоследствии – королева Вюртембергская), назван Ольгинским. Он находился сначала в Хамовниках, а позже переехал в собственный дом на Преображенской улице. В начале XX века в нем содержалось 70 мальчиков, которые обучались в 1–3 общих классах и в 4-м, где преподавались черчение и рисование. Окончившие курс воспитанники могли поступать в техническое училище, принадлежавшее Совету детских приютов.
В 1910–1911 гг. в ознаменование рождения наследника престола цесаревича Алексея к приютскому зданию с западной стороны пристроили в виде обширной залы церковь святителя Алексия митрополита Московского. Ее освятили 28 сентября 1911 г. В ней находился двухъярусный, художественной работы иконостас. Храм закрыли в 1918 г., а уничтожили вместе со зданием приюта в начале 1930-х гг. На этом месте позднее выстроили семиэтажный дом.
Алексия, митрополита Московского, святителя, при психоневрологическом интернате № 26 церковь (Косинская улица, дом № 8).
Домовый храм святителя Алексия, митрополита Московского освящен 7 октября 1999 г. в приспособленном для этого помещении психоневрологического интерната № 23. Посвящение храма святителю Алексию, митрополиту Московскому было избрано жребием у чудотворного образа Косинской иконы Божией Матери четырехлетним мальчиком Николаем Кузмичевым. Храм приписан к церкви Успения Пресвятой Богородицы в Косине.
Алексия, митрополита Московского, святителя, в Рогожской слободе церковь (Николоямская улица, дом № 60).
Церковь получила название по южному приделу, а ее главный престол освящен во имя Феодоровской иконы Божией Матери, северный придел – во имя святителя Николая. Впервые эта церковь упоминается в 1625 г. В 1701 г. был возведен каменный храм, который сгорел в середине XVIII в. Новый храм был построен по проекту известного зодчего Д.В. Ухтомского в 1748–1751 гг. в редком для Москвы стиле елизаветинского барокко. Роспись стен в 1778–1779 гг. выполнил иконописец Сергей Нехлебаев. В четырехъярусном с вызолоченными деревянными резными статуями иконостасе находилось двадцать восемь икон. Особо почитался прихожанами чудотворный Феодоровский образ Божией Матери в серебряном окладе, богато украшенный жемчугом и бриллиантами. Предание гласило, что перед этим старинным списком начала XVII века с Костромской Феодоровской иконы Богородицы, находившейся еще в старом храме, молился государь Алексей Михайлович со свитой. Исторический интерес представляла также икона святителя Алексия, митрополита Московского, начала XIX века, изображающая его на фоне Московского Кремля. В начале XX века были проведены ремонт храма и реставрация иконостаса и икон по рекомендациям художника А.М. Васнецова и под наблюдением архитектора Ф.Ф. Горностаева. Храм закрыли в 1929 г. и передали под склад чая. Часть изъятых тогда икон ныне хранится в Третьяковской галерее. Ценнейший иконостас разобрали, его Царские врата и колонки ныне хранятся в Московском объединенном музее-заповеднике. В 1991 г. церковь возвращена верующим, в храме ведуться реставрационные работы.
Алексия, митрополита Московского, святителя, в Северном Медведкове храм-часовня (Широкая улица, дом № 27).
Деревянный шатровый храм построен по проекту архитектора Александра Левченко в формах традиционных для Русского Севера. В день памяти святителя Алексия, 2 июня 2000 г., совершено его малое освящение и отслужена первая литургия. В антиминсе пребывают частицы мощей святых мучеников Прова, Тараха и Андроника. Над входом в храм находится икона святителя Алексия, митрополита Московского, на боковых фасадах – образа Господа Иисуса Христа и Пресвятой Богородицы. Рядом с храмом выстроена небольшая деревянная звонница, колокола на ней освящены 14 апреля 2001 г. Храм приписан к церкви преподобного Серафима Саровского в Раеве.