Главный герой повести, молодой ученый по имени Артем, оказывается случайно выбранным для путешествия в прошлое. Вместе с ним в путешествие отправляется его друг и коллега, Лена, которая поддерживает его в трудные моменты.
Путешествие в прошлое оказывается для Артема и Лены настоящим испытанием. Они сталкиваются с различными опасностями, испытывают сильные эмоции и проходят через серию испытаний, чтобы достичь своей цели.
Постепенно им удается раскрыть секреты древней цивилизации кошколюдей и понять, что они не так уж и различны от современного человека. Возникает вопрос о том, насколько циклична история и существует ли возможность избежать повторения прошлых ошибок.
В конце повести Артем и Лена возвращаются в свое время, но не остаются прежними. Они принимают новый взгляд на мир и свою роль в нем, стремясь использовать полученные знания для блага человечества и предотвращения глобальной катастрофы.
Повесть "Парадокс великого Пта" заставляет задуматься о ценности знания, о важности сохранения исторического опыта и о необходимости принятия ответственности за будущее.